{"id":37874,"date":"2026-06-28T16:07:00","date_gmt":"2026-06-28T16:07:00","guid":{"rendered":"https:\/\/veganic.bio\/que-sont-les-rhizobacteries-pgpr-et-comment-elles-ameliorent-la-fertilite-des-sols\/"},"modified":"2026-07-22T15:31:59","modified_gmt":"2026-07-22T15:31:59","slug":"que-sont-les-rhizobacteries-pgpr-et-comment-elles-ameliorent-la-fertilite-des-sols","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/veganic.bio\/fr\/que-sont-les-rhizobacteries-pgpr-et-comment-elles-ameliorent-la-fertilite-des-sols\/","title":{"rendered":"Que sont les rhizobact\u00e9ries (PGPR) et comment elles am\u00e9liorent la fertilit\u00e9 des sols"},"content":{"rendered":"<p>La rhizosph\u00e8re \u2014 la zone \u00e9troite du sol directement influenc\u00e9e par les exsudats racinaires \u2014 est l&rsquo;un des environnements les plus biologiquement actifs sur Terre. Au sein de cette zone, les racines des plantes et les microorganismes du sol s&rsquo;engagent dans des \u00e9changes complexes et mutuellement b\u00e9n\u00e9fiques qui fa\u00e7onnent la nutrition, la sant\u00e9 et la r\u00e9silience des plantes. Parmi les membres les plus agronomiquement significatifs du microbiome de la rhizosph\u00e8re figurent les <strong>rhizobact\u00e9ries favorisant la croissance des plantes<\/strong>, universellement abr\u00e9g\u00e9es en PGPR.  <\/p>\n<p>Ces bact\u00e9ries b\u00e9n\u00e9fiques colonisent la surface des racines (rhizoplan) et le sol environnant, produisant une gamme de compos\u00e9s et r\u00e9alisant des fonctions m\u00e9taboliques qui favorisent directement et indirectement la croissance des plantes, am\u00e9liorent la disponibilit\u00e9 des nutriments et renforcent la r\u00e9sistance aux stress biotiques et abiotiques. Comprendre leurs m\u00e9canismes d&rsquo;action et comment les d\u00e9ployer efficacement est de plus en plus central dans la strat\u00e9gie de production agricole durable. <\/p>\n<h2>Que sont les PGPR ? D\u00e9finition et classification <\/h2>\n<p>Les PGPR sont un groupe fonctionnellement d\u00e9fini de bact\u00e9ries du sol qui, en colonisant la rhizosph\u00e8re, exercent des effets positifs mesurables sur la croissance et le d\u00e9veloppement des plantes. Elles ne constituent pas un groupe taxonomique \u2014 les PGPR se retrouvent dans de multiples genres bact\u00e9riens, notamment <em>Bacillus<\/em>, <em>Pseudomonas<\/em>, <em>Azospirillum<\/em>, <em>Rhizobium<\/em>, <em>Burkholderia<\/em>, <em>Enterobacter<\/em> et <em>Paenibacillus<\/em>, entre autres. <\/p>\n<p>Elles sont g\u00e9n\u00e9ralement class\u00e9es selon leurs m\u00e9canismes :<\/p>\n<ul>\n<li><strong>Biofertilisants<\/strong> : PGPR qui augmentent la disponibilit\u00e9 des nutriments par la fixation de l&rsquo;azote ou la solubilisation du phosphore<\/li>\n<li><strong>Phytostimulateurs<\/strong> : PGPR qui produisent des phytohormones (auxines, cytokinines, gibb\u00e9rellines) stimulant directement la croissance des plantes<\/li>\n<li><strong>Contr\u00f4leurs de stress<\/strong> : PGPR qui produisent de l&rsquo;ACC d\u00e9saminase, r\u00e9duisant les niveaux d&rsquo;\u00e9thyl\u00e8ne dans les plantes stress\u00e9es et permettant une croissance normale en cas de s\u00e9cheresse, de salinit\u00e9 ou de stress li\u00e9 aux m\u00e9taux lourds<\/li>\n<li><strong>Biopesticides<\/strong> : PGPR qui produisent des antibiotiques, des sid\u00e9rophores ou des enzymes lytiques qui suppriment les agents pathog\u00e8nes du sol<\/li>\n<\/ul>\n<p>De nombreuses souches de PGPR commercialement pertinentes op\u00e8rent simultan\u00e9ment par plusieurs m\u00e9canismes, ce qui fait qu&rsquo;une classification par m\u00e9canisme unique est une simplification excessive en pratique.<\/p>\n<h2>M\u00e9canisme 1 : Fixation biologique de l&rsquo;azote<\/h2>\n<p>L&rsquo;azote atmosph\u00e9rique (N\u2082) constitue 78 % de l&rsquo;air mais n&rsquo;est pas disponible pour les plantes sous cette forme. La fixation biologique de l&rsquo;azote (FBN) \u2014 la r\u00e9duction enzymatique du N\u2082 en ammoniac (NH\u2083) par le complexe enzymatique de la nitrog\u00e9nase \u2014 est r\u00e9alis\u00e9e exclusivement par les procaryotes. Les PGPR capables de FBN comprennent \u00e0 la fois des esp\u00e8ces symbiotiques (principalement <em>Rhizobium<\/em> et les genres apparent\u00e9s, qui fixent l&rsquo;azote \u00e0 l&rsquo;int\u00e9rieur des nodosit\u00e9s racinaires des l\u00e9gumineuses) et des esp\u00e8ces libres ou associatives.  <\/p>\n<h3>Fixation associative de l&rsquo;azote dans les cultures non l\u00e9gumineuses<\/h3>\n<p><em>Azospirillum brasilense<\/em>, <em>Herbaspirillum seropedicae<\/em> et <em>Gluconacetobacter diazotrophicus<\/em> fixent l&rsquo;azote en association \u00e9troite avec des cultures de gramin\u00e9es telles que le bl\u00e9, le ma\u00efs, le riz et la canne \u00e0 sucre, sans former de nodosit\u00e9s. La quantit\u00e9 d&rsquo;azote fix\u00e9e varie consid\u00e9rablement \u2014 5 \u00e0 40 kg N ha\u207b\u00b9 par saison \u2014 en fonction des conditions du sol, de la disponibilit\u00e9 en carbone et de l&rsquo;efficacit\u00e9 de la combinaison souche-culture sp\u00e9cifique. <\/p>\n<p>Bien que la FBN associative ne remplace que rarement enti\u00e8rement la fertilisation azot\u00e9e min\u00e9rale dans les syst\u00e8mes \u00e0 haut rendement, elle peut r\u00e9duire significativement les besoins en engrais azot\u00e9s et am\u00e9liorer l&rsquo;efficacit\u00e9 de l&rsquo;utilisation de l&rsquo;azote \u2014 particuli\u00e8rement pr\u00e9cieux sous la pression des prix de l&rsquo;azote ou dans les syst\u00e8mes \u00e0 faibles intrants et biologiques.<\/p>\n<h2>M\u00e9canisme 2 : Solubilisation du phosphore<\/h2>\n<p>Le phosphore est abondant dans la plupart des sols agricoles en termes totaux, mais la majorit\u00e9 est pr\u00e9sente sous des formes organiques ou inorganiques insolubles, indisponibles pour les plantes. Les bact\u00e9ries solubilisatrices de phosphate (PSB) \u2014 un groupe fonctionnel majeur au sein des PGPR \u2014 lib\u00e8rent le phosphore li\u00e9 au sol par deux m\u00e9canismes principaux : <\/p>\n<h3>Production d&rsquo;acides organiques<\/h3>\n<p>Les genres de PSB, y compris <em>Bacillus<\/em> spp. et <em>Pseudomonas fluorescens<\/em> \u2014 les souches actives pr\u00e9sentes dans la technologie MicroGea\u00ae de Veganic (REGESOOR\u00ae, ESCUDOOR\u00ae) \u2014 s\u00e9cr\u00e8tent des acides organiques de faible poids mol\u00e9culaire \u2014 acide gluconique, acide citrique, acide oxalique, acide malique \u2014 qui acidifient la zone racinaire et dissolvent les phosphates inorganiques de calcium, d&rsquo;aluminium et de fer. Ceci est particuli\u00e8rement efficace dans les sols alcalins et calcaires o\u00f9 la fixation du phosphate est une contrainte majeure.  <\/p>\n<h3>Production d&rsquo;enzymes phosphatases<\/h3>\n<p>Les enzymes phytases et phosphatases s\u00e9cr\u00e9t\u00e9es par les PSB min\u00e9ralisent les fractions de phosphore organique (phytate, nucl\u00e9otides, phospholipides) dans la mati\u00e8re organique du sol, lib\u00e9rant ainsi du phosphate inorganique disponible pour les plantes. Dans les sols \u00e0 forte teneur en mati\u00e8re organique, la min\u00e9ralisation enzymatique du phosphore peut contribuer substantiellement \u00e0 l&rsquo;approvisionnement en phosphore des plantes \u2014 souvent plus que la solubilisation inorganique. <\/p>\n<p>Des essais sur le terrain avec des inoculants PSB sur le bl\u00e9, le ma\u00efs et le soja d\u00e9montrent constamment des r\u00e9ductions de 10 \u00e0 25 % des besoins en engrais phosphat\u00e9s min\u00e9raux sans perte de rendement lorsque des souches efficaces sont appliqu\u00e9es dans des conditions de sol appropri\u00e9es.<\/p>\n<h2>M\u00e9canisme 3 : Production de phytohormones<\/h2>\n<h3>Acide indole-3-ac\u00e9tique (AIA) et architecture racinaire<\/h3>\n<p>La phytohormone la plus document\u00e9e produite par les PGPR est l&rsquo;acide indole-3-ac\u00e9tique (AIA), la principale auxine naturelle. Les rhizobact\u00e9ries productrices d&rsquo;AIA \u2014 y compris de nombreuses souches de <em>Bacillus<\/em>, <em>Pseudomonas<\/em> et <em>Azospirillum<\/em> \u2014 stimulent l&rsquo;\u00e9longation des poils racinaires, l&rsquo;initiation des racines lat\u00e9rales et la croissance des racines primaires \u00e0 faibles concentrations. Il en r\u00e9sulte un syst\u00e8me racinaire avec une surface et une capacit\u00e9 d&rsquo;exploration du sol significativement accrues.  <\/p>\n<p>Cette am\u00e9lioration de l&rsquo;architecture racinaire m\u00e9diatis\u00e9e par l&rsquo;AIA se traduit directement par une meilleure absorption des nutriments et de l&rsquo;eau \u2014 l&rsquo;effet du syst\u00e8me racinaire amplifie l&rsquo;impact des autres m\u00e9canismes des PGPR, cr\u00e9ant une boucle de r\u00e9troaction positive entre l&rsquo;activit\u00e9 biologique et la nutrition des plantes.<\/p>\n<h3>Cytokinines et gibb\u00e9rellines<\/h3>\n<p>Certaines souches de PGPR produisent des cytokinines qui stimulent la division cellulaire dans les m\u00e9rist\u00e8mes des pousses, favorisant le d\u00e9veloppement pr\u00e9coce du couvert v\u00e9g\u00e9tal. Les souches productrices de gibb\u00e9rellines \u2014 en particulier parmi les esp\u00e8ces de <em>Bacillus<\/em> et <em>Azospirillum<\/em> \u2014 peuvent acc\u00e9l\u00e9rer la germination, l&rsquo;\u00e9longation des semis et la croissance v\u00e9g\u00e9tative pr\u00e9coce, des effets particuli\u00e8rement pertinents pour les cultures plant\u00e9es dans des sols froids ou sous des saisons de croissance courtes. <\/p>\n<h2>M\u00e9canisme 4 : ACC d\u00e9saminase et tol\u00e9rance au stress<\/h2>\n<p>L&rsquo;un des m\u00e9canismes les plus significatifs des PGPR en pratique \u2014 particuli\u00e8rement dans le contexte de la variabilit\u00e9 climatique \u2014 est la production de 1-aminocyclopropane-1-carboxylate (ACC) d\u00e9saminase. L&rsquo;ACC est le pr\u00e9curseur imm\u00e9diat de l&rsquo;\u00e9thyl\u00e8ne chez les plantes, et la production d&rsquo;\u00e9thyl\u00e8ne augmente fortement en cas de s\u00e9cheresse, de salinit\u00e9, d&rsquo;inondation, de m\u00e9taux lourds et d&rsquo;attaque par des agents pathog\u00e8nes, d\u00e9clenchant des r\u00e9ponses au stress qui incluent l&rsquo;inhibition de la croissance, la s\u00e9nescence foliaire et l&rsquo;arr\u00eat de la croissance racinaire. <\/p>\n<p>Les PGPR qui produisent de l&rsquo;ACC d\u00e9saminase clivent l&rsquo;ACC avant qu&rsquo;il ne puisse \u00eatre converti en \u00e9thyl\u00e8ne, amortissant efficacement la pouss\u00e9e d&rsquo;\u00e9thyl\u00e8ne induite par le stress. Les plantes inocul\u00e9es avec des PGPR productrices d&rsquo;ACC d\u00e9saminase maintiennent une meilleure croissance racinaire, un potentiel hydrique foliaire plus \u00e9lev\u00e9 et moins de s\u00e9nescence pr\u00e9matur\u00e9e sous stress hydrique et salin \u2014 d\u00e9montr\u00e9 de mani\u00e8re constante chez la tomate, le colza, le bl\u00e9 et les l\u00e9gumineuses dans de multiples programmes de recherche. <\/p>\n<h2>PGPR et suppression des maladies transmises par le sol<\/h2>\n<p>De nombreuses souches de PGPR produisent des compos\u00e9s ayant une activit\u00e9 antifongique ou antibact\u00e9rienne directe contre les agents pathog\u00e8nes du sol. Les souches de <em>Bacillus subtilis<\/em>, <em>B. amyloliquefaciens<\/em> et <em>Pseudomonas fluorescens<\/em> produisent des lipopeptides cycliques (iturine, fengycine, surfactine), des compos\u00e9s volatils (2,3-butanediol) et des sid\u00e9rophores qui suppriment <em>Fusarium<\/em>, <em>Pythium<\/em>, <em>Rhizoctonia<\/em> et <em>Sclerotinia<\/em> dans la zone racinaire.<\/p>\n<p>De plus, les PGPR peuvent d\u00e9clencher une <strong>r\u00e9sistance syst\u00e9mique induite (RSI)<\/strong> \u2014 un m\u00e9canisme d&rsquo;amor\u00e7age de la d\u00e9fense de la plante enti\u00e8re qui am\u00e9liore la r\u00e9sistance aux agents pathog\u00e8nes foliaires et aux insectes par des voies d\u00e9pendantes du jasmonate\/\u00e9thyl\u00e8ne, sans le co\u00fbt en rendement associ\u00e9 \u00e0 l&rsquo;expression constitutive de la d\u00e9fense.<\/p>\n<h2>Comment appliquer efficacement les inoculants PGPR<\/h2>\n<h3>Types de formulations et leurs implications pratiques<\/h3>\n<p>Les PGPR sont disponibles commercialement sous plusieurs types de formulations, chacune ayant une dur\u00e9e de conservation, des exigences de manipulation et des caract\u00e9ristiques de performance sur le terrain diff\u00e9rentes :<\/p>\n<ul>\n<li><strong>Inoculants en poudre \u00e0 base de tourbe<\/strong> : viabilit\u00e9 cellulaire la plus \u00e9lev\u00e9e, dur\u00e9e de conservation de 2 \u00e0 6 mois sous r\u00e9frig\u00e9ration, utilis\u00e9s pour le traitement des semences et l&rsquo;application au sol<\/li>\n<li><strong>Suspensions liquides<\/strong> : application pratique par pulv\u00e9risateurs et irrigation goutte \u00e0 goutte, dur\u00e9e de conservation plus courte, sensibles aux UV et \u00e0 la temp\u00e9rature<\/li>\n<li><strong>Formulations granulaires<\/strong> : adapt\u00e9es \u00e0 l&rsquo;application en sillon, dur\u00e9e de conservation prolong\u00e9e, bonnes pour une lib\u00e9ration lente dans la zone racinaire<\/li>\n<li><strong>Poudres mouillables<\/strong> : polyvalentes, adapt\u00e9es \u00e0 l&rsquo;arrosage ou \u00e0 la fertigation, dur\u00e9e de conservation interm\u00e9diaire<\/li>\n<\/ul>\n<h3>M\u00e9thodes d&rsquo;application et compatibilit\u00e9<\/h3>\n<p>Les inoculants PGPR doivent \u00eatre appliqu\u00e9s aussi pr\u00e8s que possible de la zone racinaire au moment du semis ou de la transplantation. Consid\u00e9rations cl\u00e9s de compatibilit\u00e9 : <\/p>\n<ul>\n<li>\u00c9viter le m\u00e9lange en cuve avec des traitements de semences fongicides ayant une large activit\u00e9 bact\u00e9ricide (thirame, captane) \u2014 appliquer les PGPR et le fongicide s\u00e9par\u00e9ment ou utiliser des enrobages de semences polym\u00e8res<\/li>\n<li>Ne pas appliquer dans de l&rsquo;eau contenant des concentrations de chlore sup\u00e9rieures \u00e0 0,5 ppm \u2014 utiliser de l&rsquo;eau non chlor\u00e9e pour m\u00e9langer les formulations liquides<\/li>\n<li>\u00c9viter les applications au sol imm\u00e9diatement avant ou apr\u00e8s des applications \u00e0 forte dose de cuivre ou de zinc qui suppriment les populations bact\u00e9riennes<\/li>\n<li>Stocker les formulations \u00e0 4\u20138\u00b0C et appliquer dans la dur\u00e9e de conservation recommand\u00e9e \u2014 la perte de viabilit\u00e9 est la cause la plus fr\u00e9quente d&rsquo;\u00e9chec des inoculants PGPR<\/li>\n<\/ul>\n<h2>Conclusion<\/h2>\n<p>Les <strong>rhizobact\u00e9ries PGPR<\/strong> repr\u00e9sentent l&rsquo;un des outils les plus scientifiquement \u00e9tay\u00e9s et les plus \u00e9volutifs en pratique pour am\u00e9liorer la fertilit\u00e9 des sols et la performance des cultures au sein des syst\u00e8mes de production durable. Leur action multi-m\u00e9canismes \u2014 englobant la fixation de l&rsquo;azote, la mobilisation du phosphore, la production de phytohormones, la tol\u00e9rance au stress et la suppression des maladies \u2014 les positionne non pas comme un biostimulant \u00e0 effet unique, mais comme une intervention au niveau syst\u00e9mique dans la biologie de la rhizosph\u00e8re. <\/p>\n<p>Pour les agronomes et les conseillers agricoles, les inoculants PGPR sont plus efficaces lorsqu&rsquo;ils sont s\u00e9lectionn\u00e9s pour leur sp\u00e9cificit\u00e9 de souche \u00e0 la culture cible, appliqu\u00e9s correctement et int\u00e9gr\u00e9s dans un programme plus large qui soutient la sant\u00e9 biologique du sol \u2014 y compris le travail r\u00e9duit du sol, les apports de mati\u00e8re organique et l&rsquo;utilisation judicieuse des pesticides appliqu\u00e9s au sol et des engrais min\u00e9raux qui peuvent supprimer le microbiome natif et appliqu\u00e9.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>La rhizosph\u00e8re \u2014 la zone \u00e9troite du sol directement influenc\u00e9e par les exsudats racinaires \u2014 est l&rsquo;un des environnements les plus biologiquement actifs sur Terre. 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